4 raisons de NE PAS chiffrer ses partitions (Linux ou autre). Ce sont des raisons valables, et applicables dans la majorité des cas. Préférez TrueCrypt (notamment avec l'option de "hidden partition"). Mais le cryptage de partitions reste nécessaire dans certains cas.
On peut notamment chiffrer sa partition système et avoir une partition data en clair avec, dedans, un container TrueCrypt (ou carrément sa home TrueCrypt). C'est ce que j'ai tendance à faire d'ailleurs depuis quelques temps.